U mjesecu aprilu 2025.godine ukupno je urađeno 435.380 analiza iz 44.662 uzoraka, uzetih od 30.554 pacijenta. Udio specifičnih tercijernih analiza iznosio je 27,6%.
U toku aprila mjeseca u OJ Klinička biohemija pružene su usluge za 10. 160 ambulantnih pacijenata.
Broj zahtjeva za svim vrstama krvnih analiza/pretraga značajno je povećan u odnosu na isti mjesec prošle godine.
OJ Klinička mikrobiologija KCUS-a među prvima u regionu implementirala jeQuickMIC sistem, koji omogućava ultra brzu detekciju minimalne inhibitorne koncentracije (MIC) antibiotika direktno iz uzorka pozitivne hemokulture na automatskom analizatoru. Ova tehnologija omogućava pružanje izuzetno brze i pouzdane rezultate testiranja osjetljivosti na antibiotike, što je ključno za pravovremeno i efikasno liječenje pacijenata.
„QuickMIC sistem omogućava detekciju u vremenskom okviru od svega 2-4 sata, što predstavlja značajnu prednost u hitnim medicinskim situacijama, kao što je sepsa, gdje je vrijeme ključno za preživljavanje pacijenata. Na ovaj način, liječnici mogu odmah dobiti relevantne informacije koje im omogućavaju da odaberu najefikasniji antibiotik za liječenje infekcije, smanjujući tako rizik od neadekvatne terapije i razvoja antimikrobne rezistencije.Naš tim je posvećen integraciji najnovijih inovacija s ciljem poboljšanja kliničkih ishoda i borbe protiv antimikrobne rezistencije. Osim toga, QuickMIC sistem smanjuje opterećenje laboratorijskog osoblja, što doprinosi efikasnijem i ekonomičnijem procesu“ – kazala je šefica OJ Klinička mikrobiologija, prof.dr Amela Dedeić – Ljubović.
Jedna od glavnih prednosti ovog sistema je njegova sposobnost da vrši testiranje direktno iz pozitivnih hemokultura, što je posebno važno u hitnim situacijama gdje je brza intervencija od presudnog značaja.
Na odjelu za dijagnostiku mikobakterija OJ Klinička mikrobiologija uveden je GeneXpert MTB/RIF automatski semikvantitativni in vitro dijagnostički test reakcije polimeraze u stvarnom vremenu (PCR) za otkrivanje kompleksa DNK Mycobacterium tuberculosis complexa i mutacije povezane s rezistencijom na rifampicin u manje od dva sata.
“Globalna strategija Svjetske zdravstvene organizacije (SZO) 2015-2035. poznata kao The End TB poziva na ranu dijagnozu tuberkuloze i tuberkuloze rezistentne na antituberkulotike. Stoga, SZO preporučuje upotrebu brzih molekularnih dijagnostičkih testova i testova za otkrivanje rezistencije na rifampicin i izonijazid.
SZO preporučuje upotrebu Xpert Ultra testa (WHO operarational manual for tuberculosis, 2024.) kod odraslih osoba i djece kao i HIV pozitivnih osoba sa simptomima plućne tuberkuloze bez prethodne historije tuberkuloze ili sa historijom liječenja tuberkuloze više od 5 godina. Ovaj test shodno preporukama treba koristiti kao inicijalni dijagnostički test za tuberkulozu i za otkrivanje rezistencije na rifampicin u sputumu“ – navodi prof.dr Dedeić-Ljubović.
Kod odraslih osoba i djece kao i HIV pozitivnih osoba sa simptomima vanplućne tuberkuloze bez prethodne historije tuberkuloze ili sa historijom liječenja tuberkuloze više od 5 godina, ovaj test treba koristiti kao inicijalni dijagnostički test za tuberkulozu i za otkrivanje rezistencije na rifampicin u uzorcima likvora, a može se koristiti i u uzorcima razne vrste lavata, aspirata, punktata, bioptata, limfnih čvorova i ostalog. Svjetska zdravstvena organizacija ne preporučuje ovaj test u praćenju odgovora na liječenje.
Uvođenjem QuickMIC sistema i GeneXpert MTB/RIF automatskog semikvantitativnog in vitro dijagnostičkog testa laboratorij OJ Klinička mikrobiologija podiže ljestvicu u dijagnostici i pružanju visokokvalitetne zdravstvene zaštite.
PRESS KCUS-a
U OJ Klinička mikrobiologija je nakon specifičnog skrininga na aktuelno cirkulirajuće varijante SARS-CoV-2 i otkrivanja 10 slučajeva Omicron varijante u prošloj sedmici, urađena daljnja karakterizacija sekvencioniranjem slijedeće generacije (NGS) na aparatu MiniSeq Sequencing system Illumina.
Sekvencioniranje je urađeno na 23 reprezentativna uzorka. Kod 10 uzoraka je potvrđeno da se radi o Omicron varijanti (B.1.1.529). Kod 12 uzoraka je dokazana Delta varijanta koja od ranije cirkuliše na našim prostorima, a kod jednog uzorka Lambda varijanta (C.37), koja je kod nas dokazana po prvi put, a prema SZO određena kao varijanta od interesa (VOI).
Napominjemo da su prvi slučajevi zaraze Omicron varijantom dokazani kod pacijenata iz Domova zdravlja: Saraj polje, Stari grad, Centar i Ilidža.
U skladu sa preporukama SZO, a sa ciljem kontinuiranog nadzora nad novim varijantama SARS-CoV-2 u OJ Klinička mikrobiologija izvršeno je novo testiranje na mutacije određenog broja RT-PCR pozitivnih uzoraka.
Testiranjem su obuhvaćena 44 reprezentativna uzorka iz 4 kantona: Kanton Sarajevo, srednjebosanski, Unsko sanski i Zeničko-dobojski.
Kod svih uzoraka je dokaza specifična mutacija A570D karakteristična za lozu B.1.1.7 poznatija kao UK (Britanska) varijanta ili Variant of Concern 202012/01 (VOC -202012/1).
Na osnovu dobijenih rezultata zadnjeg testiranja zaključujemo da je ova varijanta i dalje zastupljena i cirkuliše na većem području FBiH.
Distribucija UK varijante (B.1.1.7) među uzorcima pozitivnim na SARS-CoV-2- april-maj 2021
| GRAD/KANTON | UKUPNO TESTIRANI |
| BUŽIM | 2 |
| BIHAĆ | 2 |
| BOSANKSA KRUPA | 1 |
| BOSANSKI PETROVAC | 1 |
| VELIKA KLADUŠA | 2 |
| KLJUČ | 1 |
| SANSKI MOST | 2 |
| GORAŽDE | 4 |
| FOČA/USTIKOLINA | 1 |
| OLOVO | 4 |
| KANTON SARAJEVO (CENTAR, NOVO SARAJEVO, NOVI GRAD, STARI GRAD, ILIDŽA, VOGOŠĆA/ILIJAŠ, HADŽIĆI | 24 |
| UKUPNO | 44 |
.
ŠEF OJ KLINIČKA MIKROBIOLOGIJA KCUS
Prof. dr Amela Dedeić-Ljubović
U OJ Klinička mikrobiologija su u periodu 12.03- 18.03.2021 na aparatu sljedeće generacije sekvenciranja (NGS), doniranom od strane Svjetske zdravstvene organizacije (SZO) sekvencirana 21 reprezentativna uzorka kompletnog genoma SARS-CoV-2.
Uzorci su selektirani od 61 uzorka pozitivna na SARS-CoV-2 iz 5 kantona
FBiH. Prethodnim skriningom kod 56/61 (91, 8%) uzoraka je dokazano prisustvo specifične mutacije N501Y, koja utiče na receptor- vezujuću domenu S virusnog proteina.
Na aparatu sljedeće generacije sekvenciranja kod 16/21 (76, 19%) uzoraka potvrđeno je da se radi o lozi B.1.1.7 poznatoj kao Variant of Concern 202012/01 (VOC -202012/1) ili UK varijanti. Ova varijanta je dokazana u Kantonu Sarajevo i to općinama Centar, Saraj polje, Novo Sarajevo, Stari grad, Ilidža, Vogošća/Ilijaš i Hadžići. Od ostalih Kantona u Federaciji dokazana je u Bihaću, Goraždu, Zenici, Kaknju, Zavidovićima i Travniku.Kod tri uzorka iz Kantona Sarajevo ( Ilidža i Stari grad) koji su bili negativni na ovu mutaciju, dokazana je loza B.1. 258 (CZ varijanta), te kod dva loze B.1.160 i B. 1.177.Na osnovu rezultata dobijenih dosadašnjim testiranjem zaključujemo da je UK varijanta SARS-CoV-2 u velikoj mjeri zastupljena na područuju Bosne i Hercegovine, ali da cirkuliše i loza B.1. 258 (Czech varijanta).
Sve sekvence virusa su importovane i objavljene u međunarodnoj bazi GISAID što će omogućiti komparaciju genoma naših izolata virusa sa drugim.
Tim na sekvenciranju sljedeće generacije (NGS) SARS-CoV-2 u OJ Klinička mikrobiologija
Na Kliničkoj mikrobiologiji Kliničkog centra Univerziteta u Sarajevu danas je otkriveno prisustvo novog soja virusa SARS- CoV -2. Od 18 testiranih uzoraka novi soj virusa potvrđen je kod 15 građana, a na osnovu podataka molekularne epidemiološke situacije na globalnom nivou, procijenjeno je da se radi o britanskom soju.
Prema riječima šefice OJ Klinička mikrobiologija, prof.dr. Amele Dedeić – Ljubović uzorci koji su uključeni u ovo pilot testiranje zaprimljeni su 24. i 25. februara 2021. godine u Laboratorij za molekularnu dijagnostiku virusa KCUS-a.
„Uzorci su probrani na osnovu visokog pozitiviteta za prisustvo SARS-CoV-2 i sa različitih lokaliteta. S odručja Kantona Sarajevo uzeti su uzorci iz općina Stari Grad (3 uzorka), Centar (2 uzorka), Novi Grad (3 uzorka), Ilidža (3 uzorka) i Vogošća (4 uzorka). S područja Unsko – sanskog kantona uzorci su uzeti u Bihaću (1 uzorak) i Cazinu (2 uzorka). Standardni soj koji potiče iz Wuhana, detektovan je kod preostala 3 od 18 testiranih uzoraka (po jedan iz Starog Grada, Ilidže i Vogošće)“ – kazala je prof. Dedeić -Ljubović.
Varijante SARS-CoV-2 definisane su specifičnim asortimanom mutacija, od kojih su mnoge od relativnog značaja, kako za evoluciju virusa tako i za javno zdravlje. Direktorica Dijagnostičkih disciplina KCUS-a, prof.dr.Sandra Vegar –Zubović ističe de se, sa naučnog gledišta, u fokusu interesa nalaze tri varijante virusa koje karakteriše brže širenje.
„To su varijanta početno identificirana u UK (B.1.1.7), varijanta koja potiče iz Južne Afrike (B.1.351) i varijanta brazilskog porijekla (B.1.1.28). Za sve ove tri varijante virusa zajedničko je prisustvo najznačajnije N501Y mutacije koja utiče na receptor- vezujuću domenu S virusnog proteina. Virus se svojim S proteinom spaja sa specifičnim celularnim receptorom što mu omogućava prodor u humanu ćeliju tokom infekcije. Otkrivena mutacija N501Y potencijalno omogućava čvršću vezu virusa sa receptorima humanih ćelija. Bitno je napomenuti da svi rutinski real-time RT-PCR testovi koji se izvode u KCUS- OJ Klinička mikrobiologija detektuju gene koji nisu obuhvaćeni mutacijama, što nam omogućava otkrivanje kako početnih (Wuhan), tako i varijantnih loza SARS-CoV-2. To se dodatno potvrdilo i ovim testiranjem“ – izjavila je prof.dr.Vegar -Zubović.
Generalna direktorica KCUS-a, prof.dr.Sebija Izetbegović ističe da najnoviji rezultati testiranja pokazuju da su nove varijante SARS-CoV-2, koje dijele najznačajniju- N501Y mutaciju, u velikoj mjeri zastupljene i cirkulišu na područuju Bosne i Hercegovine.
„U posljednjih nekoliko dana zabilježen je znatan porast broja Covid-19 bolesnika, a trenutno u Izolatoriju imamo 90 hospitaliziranih. Kapacitet izolatorija na Podhrastovima je 105 bolesničkih kreveta. Najnoviji podaci govore da u narednih nekoliko dana možemo očekivati i dodatni porast oboljelih. Svjesni ozbiljnosti situacije danas smo održali hitnu sjednicu Kriznog štaba KCUS-a na kojoj smo donijeli niz bitnih odluka u cilju unaprijeđenja rada i poboljšanja postojećih usluga. Jedna od današnjih odluka je formiranje respiratornog centra sa 40 bolesničkih kreveta u krugu KCUS-a, u zgradi stare Hirurgije. Na ovaj način ćemo proširiti kapacitete za srednje teško bolesne u izolatoriju Podhrastovi, dok će izrazito teški bolesnici za koje je neophodna invazivna respiratorna potpora biti hospitalizirani u novom respiratornom centru u krugu KCUS-a. Ovakva organizacija rada olakšaće i našim ljekarima u smislu brže komunikacije, a shodno multidisciplinarnom pristupu u liječenju korona bolesnika. Planiramo da se radovi na opremanju respiratornog centra završe tokom vikenda, kako bismo početkom naredne sedmice premjestili bolesnike, medicinsku i dijagnostičku opremu. Treći val korona virusa mogao bi biti i najteži do sada, s obzirom da je zabilježena mutacija virusa, koji je po pisanjima stranih medija znatno zarazniji a pacijenti imaju dosta teže kliničke slike. U ovakvim uslovima moramo unaprijed razmišljati i poduzeti apsolutno sve što je u našoj moći kako bismo zaštitili naše građane. Svjesni smo i činjenice da su građani umorni od maski i konstantnih epidemioloških mjera, ali do dolaska vakcine moramo biti strpljivi. Svako popuštanje mjera moglo bi imati nesagledive posljedice po zdravlje svih nas. Osoblje KCUS-a će požrtvovano i predano raditi za dobro naših pacijenata“ – poručila je prof.dr.Izetbegović.
PRESS KCUS
KLINIČKI CENTAR UNVERZITETA U SARAJEVU
OJ Klinička mikrobiologija
OJ Kliničkoj mikrobiologiji KCUS kao referalnoj laboratoriji doniran je od strane Svjetske zdravstvene organizacije (SZO) aparat nove generacije sekvencionera (NGS) za unaprijeđenje dijagnostike SARS-CoV-2.
Prof. dr. Sandra Vegar Zubović , direktorica dijagnostičkih disciplina, je navela da je na aparatu obavljena edukacija uposlenika za detekciju novih varijanti SARS-CoV-2, čime su se stekli kapaciteti i za ovaj nivo dijagnostike.
„Sekvence kompletnog genoma virusa uvrštene u međunarodnu bazu podataka omogućiti će komparaciju genom naših izolata virusa sa drugim, molekularno-epidemiološko praćenje cirkulisanja virusa na našem području, te importovanje novih varijanti SARS-CoV-2“, pojasnila je prof. dr. Vegar Zubović.
Prema riječima prof. dr. Amele Dedeić Ljubović, šefice OJ Klinička mikrobilogija, navedena metodologija nije rutinska, već će se prevashodno koristiti u epidemiološke i istraživačke svrhe.
„Za detekciju novih varijanti virusa od naročitog je značaja ciljano testiranje uz usku saradnju sa epidemiološkim službama. Prednost navedene metodologije je mogućnost njene aplikacije ne samo u oblasti infektivnih bolesti, već i u ostalim oblastima dijagnostike. Također, poručili smo testove za novu varijantu virusa, tzv. britanski soj. Uskoro očekujemo njihovu isporuku u KCUS“, poručila je prof.dr.Dedeić Ljubović.
Prof. dr. Sebija Izetbegović, generalna direktorica KCUS je istakla da je od početka COVID-19 i identifikacije novog koronavirusa (SARS-CoV-2), laboratorije širom svijeta generišu podatke o sekvencama njegovog genoma doprinoseći razumjevanju ovog oboljenja i istraživanju odgovarajuće terapije i vakcine.
„U KCUS je od 31. janura 2020. do 31. janura 2021. godine na mikrobilogiji urađeno je 145.334 analize na Covid-19 , što je omogućilo stvaranje najznačajnije i najbrojnije „banke“ sojeva SARS-CoV-2 za brojna istraživanja. Sekvence genoma su, između ostalog, neophodne u razvoju dijagnostičkih testova, praćenju pandemije, te iznalaženju odgovarajućih mjera prevencije i kontrole. KCUS je najveća zdravstvena ustanova u državi i pravovremeno je prepoznala ozbiljnost i težinu posla koji sa sobom nosi borba sa COVID-19 pandemijom. Nastavljamo ovim tempom i ponosni smo, što osim liječenja naših pacijenta, pomažemo i doprinosimo i naučnom napretku BiH“, rekla je prof. dr. Izetbegović.
KCUS
Od početka COVID-19 i identifikacije novog koronavirusa (SARS-CoV-2), laboratorije širom svijeta generišu podatke o sekvencama njegovog genoma doprinoseći razumjevanju ovog oboljenja i istraživanju odgovarajuće terapije i vakcine. Sekvence genoma su, između ostalog, neophodne u razvoju dijagnostičkih testova, praćenju pandemije, te iznalaženju odgovarajućih mjera prevencije i kontrole.
U KCUS je do sada testirano oko 25.000 uzoraka na COVID-19, što je omogućilo stvaranje najznačajnije i najbrojnije „banke“ sojeva SARS-CoV-2 za brojna istraživanja, značajna za akademsku zajednicu BiH. S tim u vezi, u saradnji sa eminentnom Referalnom laboratorijom SZO Charité u Berlinu, na čelu sa prof. Christian Drostenom urađeno je sekvenciranje prve grupe izolata SARS-CoV-2. Time FBiH trenutno raspolaže sa prvih 27 sekvenci kompletnog genoma izoliranog virusa, predhodno detektovanih na OJ Klinička mikrobiologija KCUS.
U narednim danima očekujemo njihov unos u međunarodnu bazu podataka (GISAID –www.gisaid.org), kako bi bile uporedive sa genomom virusom iz ostatka svijeta. Ovo je revolucionarno za cijelu akademsku zajednicu u BiH, jer nas uvrštava u svjetsku bazu kompletnih genoma ovog virusa. Filogenetski podaci koji upoređuju genom naših izolata virusa sa drugim, omogućiti će molekularno-epidemiološko praćnje cirkulisanja virusa na ovom geografskom području, prisustvo endemskih sojeva, te import novih varijanti SARS-CoV-2.
O svim narednim dešavanjima na ovom polju, blagovremeno ćemo obavještavati širu akademsku zajednicu.
Laboratorij za dijagnostiku COVID-19 pri OJ Klinička mikrobiologija KCUS