Klinika za infektivne bolesti obavlja stručnu, naučnu i edukacijsku djelatnost iz oblasti infektivnih oboljenja. U okviru Klinike provode se prijem, dijagnostika i terapija kroz ambulantno-poliklinički rad, hospitalno liječenje i konzilijarno-konsultativne usluge. Klinika se bavi i istraživačkim radom te edukacijom kadra.

Klinika je najveća ustanova ove vrste u Bosni i Hercegovini i jedna od najvećih u regionu, sa educiranim kadrom i savremenim tehnologijama koje se koriste u prevenciji, dijagnostici i liječenju infektivnih bolesnika.

Djelatnost Klinike obuhvata zbrinjavanje vitalno ugroženih pacijenata, dijagnostiku i liječenje HIV/AIDS-a, oportunističkih infekcija, spolno prenosivih i tropskih bolesti, kao i prevenciju i tretman infektivnih bolesti u transplantologiji i imunodeficijencijama.